Добрый день. такая беда SOS, SOS. МКПП  

Не по данной модели,а в обще. То что Вы описываете У Вас плохо работает сцепление сам механизм не главный цилиндр. Так как на данной модели установлен гидравлический выжимной можно предположить что проблема в нем.
Грохот в коробке и вибрация бывает если сцепление установлено как то не так, к примеру не отцентровано при установке. Попробуйте сменить сервис, и попросите что бы Вам отцентровали сцепление, далее по новой прокачайте систему сцепления,хотя если бы там был воздух,то педаль бы уходила,вам приходилось её накачивать

гид выжимной поменял, сцепление отцентровали итог тоже

"Сначала туго включались передачи" "потом на нейтрали когда отпускал педаль сцепления машина как будто на скорости ехала" - это не коробка. У Вас по какой то причине не происходит включение и выключение передачи. Тугое включение встречалось на Газелях при перегреве лепестков корзины.
Второе Вы как бы выключаете ,а она не выключается. На передне приводном автомобиле коробка расположена не под рычагом. Можно ещё посмотреть привод включения передачи от рычага до коробки, на многих машинах он регулируется, может там какой то износ каких нибудь втулок,тяг. Это может быть когда Вы выключает а оно не выключается, также и плохое включение первой передачи (встречалось на Гольф 4) И от него же возможно попадание на другую передачу.
"при нажатие на педаль сцепления от коробки грохот и ее колбасит"-это сцепление
Сцепление передает крутящий момент от маховика на коробку. Вы пидаль выжили а там вибрация.
Коробка обычно шумит при движении, передачи не включаются и то это кулиса,или передачи вылетают.
Спасибо буду знать,что может быть такое на джентре.
А сцепление какое ставили. Везде Валио рекомендуют.