Аналогично было на Фабии. Мастера чего только не пытались предполагать, даже катализатор поменяли... В итоге нашел сам: верхняя опора КПП, которая по сути как сайлент-блок при ускорении переставала работать и появлялся контакт металл-металл без участия резиновой части опоры. В салоне ощущалось не как вибрация, а как весьма и весьма ощутимый рев.