Добрый день! Если обгонная муфта генератора исправна, то значит проблема где-то в плохом контакте. Когда снимал-ставил генератор, может где-то провода повредил? Лампа стояночного тормоза мигает в унисон - это предупреждение, что заряда на аккумулятор нет. Любой автоэлектрик должен тебе найти место плохого контакта. Масса, возможно где-то оборвана. Смотри проводку.