Снимается ЭБУ, разбирается. Вместо родной микросхемы впаивается разъем под аналогичную микросхему.
В чистую микросхему программатором заливается прошивка. Затем этот чип вставляется на место оригинального.
Разъем вставляют для того, чтобы потом менять прошивку (=микросхему) быстро и без паяльника.
В эспере мозги нельзя стереть, потому такие ухищрения.
P.S причем тут бортовой компьютер? Это другая вещь